Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DEV8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DEV8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DEV8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DEV8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DEV8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms