Protein–RNA interactions for Protein: A6NC62

RBAKDN, Putative RBAK downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKDNA6NC62 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms