Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSDA5PKW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms