Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZNF410-219ENST00000556797 1311 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CPNE4-210ENST00000512332 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CEACAM5-201ENST00000221992 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ACSL5-205ENST00000433418 3281 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC020951.1-201ENST00000624361 2271 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OR10T2-201ENST00000334438 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 C10orf82-201ENST00000369210 994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZDHHC4P1-201ENST00000396712 1035 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC073263.1-202ENST00000401851 924 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FAM236D-201ENST00000419795 433 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RPP21-223ENST00000436442 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC009948.2-201ENST00000437039 713 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC245517.3-201ENST00000440562 250 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL096701.1-201ENST00000445477 457 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 UBE2D4-206ENST00000446008 783 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC013472.1-202ENST00000455081 558 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FAM236D-202ENST00000458170 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RN7SL402P-201ENST00000465059 264 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RN7SL384P-201ENST00000490382 298 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FXYD6P3-201ENST00000495569 285 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC079238.1-201ENST00000509840 1009 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC083841.2-201ENST00000510610 602 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OR7E5P-201ENST00000529916 706 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RAB6A-209ENST00000541973 1104 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL355922.3-201ENST00000556341 578 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC025518.2-201ENST00000605229 492 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC007551.2-201ENST00000613889 389 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GRIA3-206ENST00000616590 784 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SERPINB11-208ENST00000623262 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LAMTOR5-AS1-246ENST00000630298 858 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FAM236C-201ENST00000636267 463 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FAM236C-202ENST00000636532 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZP2-204ENST00000574091 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CSRP3-201ENST00000265968 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SDCBP-212ENST00000523483 3589 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PEX2-204ENST00000520103 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 DMP1-202ENST00000339673 2682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC113554.2-201ENST00000577647 4862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC245291.2-201ENST00000451224 1651 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CTAGE14P-201ENST00000397819 2403 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PLEKHA6-201ENST00000272203 7401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 CLRN1-201ENST00000295911 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 OR52E4-201ENST00000316987 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SPINK4-202ENST00000379725 533 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL589935.1-204ENST00000423255 407 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC00674-201ENST00000435469 678 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ADI1P1-201ENST00000438914 538 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC01501-203ENST00000449990 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 MRPS33-204ENST00000469351 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZNF525-203ENST00000475179 1868 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ILF2P1-201ENST00000486302 1168 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 HULC-201ENST00000503668 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC02213-201ENST00000504650 518 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC01299-201ENST00000520902 2634 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AP000424.1-201ENST00000521851 558 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 HAVCR2-204ENST00000522593 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 GS1-24F4.2-202ENST00000531701 380 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 SIRPB1-213ENST00000568365 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AP005265.1-201ENST00000584914 872 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AP001017.1-201ENST00000591378 482 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZNF528-210ENST00000594530 544 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC01344-203ENST00000608183 2631 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PACERR-201ENST00000608917 825 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL022322.1-201ENST00000609162 1433 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC245297.3-201ENST00000611769 838 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 IFITM2-206ENST00000616316 892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AC244093.2-201ENST00000620102 524 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL118508.2-201ENST00000622708 673 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL022329.3-201ENST00000624255 352 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 LINC00595-215ENST00000635422 651 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A21P-202ENST00000623715 3588 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 AL662907.2-201ENST00000624339 3448 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PLS3-AS1-202ENST00000607680 1763 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 ZC4H2-203ENST00000447788 2649 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 RNF14-205ENST00000394520 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 FBXL13-202ENST00000379305 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 NOS2-202ENST00000621962 3345 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LMO3Q8TAP4 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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