Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRXN3Q9Y4C0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms