Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAN1Q9Y2M0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms