Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2IPQ9Y2D8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms