Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS2Q9Y248 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS2Q9Y248 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms