Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVW-1Q9UQF0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms