Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BARX2Q9UMQ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX2Q9UMQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms