Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
INO80Q9ULG1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms