Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND2AQ9ULE3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms