Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA11Q9UKX5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms