Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms