Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms