Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA4Q9UI42 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms