Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms