Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-18Q9QC07 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-18Q9QC07 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-18Q9QC07 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-18Q9QC07 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-18Q9QC07 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVK-18Q9QC07 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms