Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGAP28Q9P2N2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP28Q9P2N2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms