Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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