Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKIRAS2Q9NYR9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKIRAS2Q9NYR9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKIRAS2Q9NYR9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS2Q9NYR9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms