Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3EQ9NVU0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3EQ9NVU0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms