Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL1Q9NSC2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms