Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOPORSQ9NS56 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms