Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INCENPQ9NQS7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INCENPQ9NQS7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms