Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms