Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKRIP1Q9H875 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms