Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAS3Q9H6U6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms