Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms