Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS3Q9BZE2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUS3Q9BZE2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS3Q9BZE2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms