Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM55Q9BYV6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms