Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC106Q9BWC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms