Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms