Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP1Q99575 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POP1Q99575 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POP1Q99575 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POP1Q99575 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POP1Q99575 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POP1Q99575 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms