Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EYA3Q99504 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms