Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH12Q96NR8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms