Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPNS2Q96L46 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms