Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms