Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A3Q96HJ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms