Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO17Q96EF6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms