Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1AQ96AJ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms