Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms