Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms