Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBXQ8WY36 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBXQ8WY36 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms