Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD43

TRPM4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4Q8TD43 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRPM4Q8TD43 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPM4Q8TD43 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPM4Q8TD43 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPM4Q8TD43 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPM4Q8TD43 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPM4Q8TD43 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPM4Q8TD43 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms