Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms