Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms