Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC44A5Q8NCS7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC44A5Q8NCS7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms