Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC117Q8IWD4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms