Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHDQ86WU2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHDQ86WU2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHDQ86WU2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms